A estrutura do ICHS conta com órgãos colegiados, órgãos operacionais e assessorias. O órgão colegiado é:
Colegiado de Unidade – Colegiado máximo da unidade de ensino, presidido pelo Diretor da Unidade e integrado por 10 professores e 2 representantes discentes;
Os órgãos operacionais são a Direção, os Departamentos de Ensino, onde os professores estão lotados, e as Coordenações de Curso, que gerenciam as operações dos cursos, a saber:
Direção – É o órgão responsável pela gestão acadêmica da unidade fazendo a articulação entre os órgãos técnico-administrativos da universidade, as Pró-Reitorias, os Departamentos de Ensino e as Coordenações de Curso;
Cinco Departamentos (Administração e Administração Pública – VAD, Ciências Contábeis – VCO, Psicologia – VPS, Direito – VDI e Multidisciplinar – VMD), cada um com o seu respectivo colegiado;
Seis Coordenações de Curso de Graduação (cursos presenciais: Administração, Administração Pública, Ciências Contábeis, Psicologia e Direito; semipresencial: Administração Pública), cada um com o seu respectivo colegiado;
Quatro Coordenações de cursos de pós-graduação lato sensu (MBA em Marketing, Gestão em Administração Pública, Gestão em Saúde Pública e Gestão Pública Municipal), com um único colegiado para os cursos semipresenciais;
Em termos de pessoal administrativo para o ano de 2012, são 24 servidores (entre administradores e técnicos administrativos) e 13 funcionários contratados.
Existem ainda alguns órgãos sediados no Campus, mas que não estão subordinados à direção da ICHS como a Biblioteca do Aterrado
BAVR que é gerida pela Superintendência de Comunicação – SDC (http://www.ndc.uff.br/)
